說起反轉錄,小編相信當大家提取出高質量的RNA時,肯定開心的手舞足蹈,滿心歡喜想著接下來的實驗輕輕松松搞定!這樣想沒錯,但是如果你想在論文或者匯報中得到漂亮的數據,那反轉錄這一步也非常關鍵。所以今天小編給大家梳理了反轉錄實驗過程中需要注意的幾個要點,希望大家在實驗過程中多多留意,獲得漂亮的數據。
一、選擇最佳的反轉錄引物
反轉錄引物一般分為三類:oligo dT、隨機引物、基因特異性引物。oligo dT,可識別具有poly(A)尾的真核mRNA,從而獲得真核生物mRNA全長。隨機引物,可以結合到樣本中的任何類型RNA,但并不能獲得整個基因全長的cDNA。基因特異性引物,是根據實驗者的特定需求設計出來的,適用于目的序列已知的情況,產生所需的cDNA。
二、考慮RNA的二級結構
若要獲取全長RNA的反轉錄,那么我們就需要考慮RNA內部是否含有二級結構,因為反轉錄酶在遇到二級結構時會終止反應或從模板上脫落下來。通常GC含量高的基因意味著RNA很難被變性且不可能是單鏈。高效且熱穩定性強的反轉錄酶,可有效克服高GC、低豐度模板的反轉錄難題。
三、去除基因組DNA
污染性基因組DNA(gDNA)可能會干擾RNA反轉錄,并導致后續PCR或qPCR實驗結果出現假陽性、高背景或檢測率低等情況。通常在RNA提取過程中加入合適濃度的DNase I,37℃加熱10-15min,去除干擾基因組DNA。另外,如果是做qPCR實驗,更簡單的方法則是選用含有去除基因組DNA的試劑盒。
四、選擇合適的反轉錄方法
RT-PCR和RT-qPCR有兩種選擇:一步法和兩步法。一步法,反轉錄和(q)PCR擴增是在同一個反應管中進行。兩步法,反轉錄與(q)PCR擴增反應單獨進行。兩種方法各有優缺點。
注意事項這么多,您需要一套可全面應對上述問題的高性能產品!
GenStar新一代StarScript III M-MLv反轉錄酶,擁有卓越的cDNA合成能力,全面提升合成產量、提高熱穩定性,克服了低豐度、復雜模板難題!
產品特點
·熱穩定性
可耐受37-65℃反應溫度,適合高GC復雜模板的反轉錄反應。
·兼容性強
適用于不同物種、各種類型的RNA模板。
·靈敏度高
針對各種RNA模板,克服低豐度、復雜模板難題。
·產品全面
根據不同的實驗應用場景,可選擇含去基因組試劑、預混試劑或試劑盒。
·應用廣泛
可應用于基因全長cDNA合成、qPCR等實驗。
產品性能展示
1. StarScript III耐受37-65℃反應溫度

不同的反轉錄反應溫度獲得的水稻cDNA,1 kb片段擴增
StarScript II最佳反應溫度為42℃,耐受50℃;StarScript III最佳反應溫度50-55℃,耐受65℃。
2. 低豐度、復雜模板也能完美反轉錄

以水稻RNA為模板,不同品牌反轉錄反應后,qPCR檢測結果
GenStar StarScript III靈敏度高,對于高GC、低表達基因的檢測效果理想。
3. 線性范圍廣,反轉錄效果佳

GenStar StarScript III一步法qRT-PCR試劑盒-探針法(UNG)(Cat#A338)檢測小鼠RNA模板,檢測基因GAPDH
結果顯示,A338靈敏度高,檢測下限可達1 pg;熒光信號采集能力強,兼顧高擴增效率;具防污染體系,有效避免氣溶膠污染。
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cDNA第一鏈合成試劑盒/預混試劑
·反轉錄試劑盒:包含反轉錄反應的全套試劑,可直接使用可調整使用。
·反轉錄預混試劑:反轉錄反應無需調整,操作簡便。
·去基因組反轉錄預混試劑:去gDNA,定量結果準確可靠。
·一管化去基因組反轉錄預混液:一管化、含去gDNA,qPCR模板制備的最佳選擇。

一步法RT-PCR
一步法RT-PCR專用預混液,反轉錄和PCR在同一管內進行,操作便攜。

一步法qRT-PCR
高特異,高靈敏,速度快,可選防污染體系,適用于RNA病毒檢測的qRT-PCR預混液。
